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各組職掌
企劃組 家畜組 家禽組 驗證組 肉檢組 行政組 技術服務中心 永續經營組
永續經營組職掌如下：

一、執行禽畜糞堆肥場營運管理與輔導等事項。
二、輔導禽畜糞尿處理及再利用技術與品質改進等事項。
三、推廣禽畜糞堆肥產品及開發國內、外市場通路。
四、輔導畜牧場廢水、異味處理及節水減廢、節能減碳等事項。
五、執行畜牧糞尿水資源化再利用之審核與管考業務。
六、執行畜牧場死廢畜禽輔導及查核等業務。
七、執行畜牧產業團體化製車收受畜牧場死廢畜禽之查核工作。
八、畜牧污染防治設備提升之規劃、引進與管理業務。
九、協助畜牧污染案件之輔導及改善。
十、蒐集及研析國內、外畜牧污染防治技術及法規等業務。
十一、畜牧溫室氣體排放清冊資料之彙整及研析。
十二、其他有關畜牧污染防治業務或中央政府委託及補助事項。
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