一、申請資格：
符合「優良豬飼養管理規範」（附件一）之養豬場。
二、申請期間與方式：
由中央畜產會函知各縣市政府起一個月內，由產業團體彙集或個別養豬場向轄區縣市政府提出申請。
三、優良養豬場認證作業流程：
（一）申請認證：
申請人應檢具下列資料一式三份，向各縣市政府提出申請，有使用廚餘養豬之豬場暫不得申請。
1.養豬場基本資料表（附件二）。
2.畜牧場登記證書影本（切結與正本相符）。
3.養豬場位置圖及平面配置圖。
4.生產管理計劃書（內容至少包括：豬場概況、飼養管理流程、飼料來源、衛生防疫措施及免疫計畫、病死豬及淘汰豬與廢污之處理、肉豬銷售管道等）。
5.專任（特約）獸醫師（佐）執業執照影本（切結與正本相符）。
（二）資料審查
1.縣市政府應自截止申請日起七日內完成書面資料審查作業，書面資料不符且未能於指定時間內完成補評者，抽存乙份後予以退件，退件戶於本年度不再接受申請，並將審查結果函知申請人。
2.書面資料審查結束後，縣市政府應依審查結果分別造冊（通過或未通過），審查通過者連同申辦資料二份，函送中央畜產會複審，另一份由各縣市政府存查。
3.中央畜產會複審後，立即安排現場評核作業。
（三）現場評核
1.現場評核依現場評核要點，由中央畜產會邀集現場評核委員組成評核小組執行之。
2.現場評核小組應自書面資料送達起四十日內，完成現場評核作業，並將「優良養豬場認證現場評核表」（附件三）送交中央畜產會，再由中央畜產會寄送「優良養豬場認證現場評核表」乙份予轄區縣市政府存查。
3.評核前作業：
（1）由執行單位召集各區評核小組委員召開評核前會議，統一評核標準，並協商評核時所應準備及注意事項。
（2）依專長別訂定評核作業分工，分派各小組委員填具「優良養豬場認證現場評核表」項目。
（3）評核小組至現場評核前，應檢視書面資料，並將「優良養豬場認證現場評核表」附於申請表。
4.評核步驟：
（1）資料評核：申請人應出示申辦資料正本，供評核小組核對所載事項。
（2）實地評核：評核小組進入評核之養豬場時，應依照其防疫規定，並更換由豬場提供或自備之防疫衣物。
（3）現場評核：由申請人親自或派相關人員，引導評核小組進行說明。
（4）內部討論：評核小組召集人主持評核資料及現場評核結果之討論，並作成現場評核結果報告，填具「優良養豬場認證現場評核表」。
（5）評核總結：由召集人口頭報告評核結果，並與申請人逐項討論後，請申請人在「優良養豬場認證現場評核表」上簽名確認。
（6）現場評核有一項嚴重缺失者即屬未通過，本年度不再接受申請。
5.養豬場自現場評核通過後45天內，應以書面或電話提供肉豬上市日期及銷售地點至少二車次，予中央畜產會，進行終端產品採樣檢測工作。
6.養豬場應配合上項檢測工作，將上市肉豬送往配合本計畫執行之銷售地點（附件四）。
7.養豬場未能配合致採樣人員無法至採樣點採集樣品者，執行單位得予以註銷申請。
（四）藥物殘留檢測
1.分為飼料藥物殘留檢測及血液藥物殘留檢測（附件五），其採樣點包括：
（1）該養豬場餵飼60公斤以上肉豬使用之飼料。
（2）養豬場內60公斤以上至上市前之豬隻血液。
（3）養豬場運送至銷售地點（或出售前）之豬隻血液。
2.飼料藥物殘留主要檢測項目為磺胺劑及受體素。
3.血液檢測項目包括抗生素、磺胺劑及受體素，抽測之豬隻包括：
（1）該養豬場60公斤以上至上市前之肉豬；由抽測人員逢機選擇3頭，每頭採集豬隻血液60㏄，養豬場應派員協助保定工作，血液採集過程中若發生豬隻死亡，概由養豬場自行負責。
（2）通過現場評核之養豬場，由採樣人員或委託並派員會同至銷售地點採集豬隻血液；每車次逢機選擇3頭，每頭採集豬隻血液60㏄，每場二車次，血液採集過程中若發生豬隻死亡，除銷售地點另有規定外，概由養豬場自行負責。
4.樣品採集得於現場評核同時，或排定行程並於三日前書面或電話通知養豬場，養豬場應配合採樣工作。
5.採樣人員應將樣品儘速送交檢驗單位，檢測項目及數量視實際狀況而定。
6.檢驗單位於收到樣品後，應於二十日內完成檢驗工作，並將結果送交主辦單位。
（五）認證核定
中央畜產會將通過現場評核及藥物殘留檢驗結果彙整後，函請「認證核定委員會」召開委員會議，進行核定工作。
（六）認證通過標準
1.現場評核結果達八十分（含）以上，且通過藥物檢測者始為合格。
2.評核結果未達八十分或有一項嚴重缺失者，當年度不接受重新評核的申請。
四、簽約與授證：
申請人通過「優良養豬場認證」後，由主辦單位陳報行政院農業委員會核備並辦理簽約及授證。
五、收費標準：
為提高養豬場申請認證意願並減輕業者負擔，暫不收取費用。
六、後續監測：
（一）後續監測項目包括重新評核、藥物殘留查核及不定期追蹤評核等。
（二）本計畫執行期間，通過認證之養豬場每二年重新評核一次，期間並得視狀況每年進行一至二次不定期追蹤評核；程序同現場評核，評核不合格者，逕取消其認證資格。
（三）通過認證之養豬場，認證主辦單位將不定期依照「藥物殘留檢測」之規定採集血液樣品，執行藥物殘留查核工作；經檢出受體素或檢出其他藥物殘留二次不合格者，認證主辦單位得逕自取消其認證資格，並陳報主管機關備查。
（四）已獲認證之養豬場，其負責人及專業人員若有變動時，應通知認證主辦單位；必要時，認證主辦單位得安排重新評核或不定期查訪。
（五）本計畫執行期間認證單位如有變更時，經認證通過之養豬場，應遵照後續主辦單位之規定，並保有通過認證資格，不因此影響養豬場權益。
